1.文献检索：可以使用NCBI Pubmed数据库查阅文献。使用NCBI Entrez Gene数据库查阅蛋白质和肿瘤的相关研究信息。也可以使用NCI网站查阅肿瘤相关基因的信息。

2.明确靶标：确定肿瘤相关基因的DNA和蛋白质的序列。一般以Refseq序列为基本标准。NCBI SNP数据库和OMIM数据库检索，确定基因的改变（INDEL、Translocation、Fusion）与肿瘤的关系。

3.明确研究进展：使用NCBI blast蛋白质结构是否已完全解析。如果已经完成，到PDB 数据库下载相关蛋白质的结构数据。如果尚未完成，考虑使用swiss-model进行同源模建。

4.蛋白质结构分析明确药物作用的潜在靶点：使用Pymol和pocketpicker等。

1.使用AutoDockTools明确蛋白质靶点的坐标。

2.登陆www.vslead.com网站，上传蛋白质文件和靶点信息。选定用来筛选的小分子化合物数据库，譬如中草药，天然产物，或现有药物库。

3.下载筛选结果。

4.使用Pymol或AutoDockTools对结果进行人工评判。

1.小分子活性验证：根据蛋白质的特性设计相关实验，购买相关化合物。采用双盲加对照实验进行验证（生化、细胞、动物）。

2.作用机制：分子动力学（使用Amber软件）分析了解小分子和蛋白质之间的作用机理。

3.申请专利、发表文章。

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