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随着近年来功能性基因组学和结构基因组学的发展,在现代药物发现中使用虚拟筛选发现新的先导化合物已成为一种普遍的做法。其基本途径为通过对蛋白质的结构进行分析,选定适当的药物靶点,针对该靶点利用现有的小分子库进行一对一的模拟分子对接,然后预测小分子的构象和结合亲和力。基于分子对接的小分子化合物的虚拟筛选是目前最有潜力的药物开发工具,可以有效的节约时间和费用,辅以计算辅助药物设计,基本可以确保发现新的先导化合物。

北京北科德源生物医药科技有限公司计算机辅助药物筛选平台构建于北京市计算中心超算平台之上。该平台选用当前最受关注的基于分子对接的虚拟筛选技术,利用开放源代码的分子对接软件或商业软件,并辅以自主开发,每天可以有效开展多达100万小分子的虚拟筛选,是目前国内最大的in silico药物筛选平台之一。该平台旨在面向国内外药物研发科研院所和企业,提供蛋白质靶向的小分子药物虚拟筛选运算和分析服务。使用户降低技术和经济门槛,节约开发和管理成本,提高资源利用率,并促进科技进步和技术创新,为用户创造长期的市场效益和潜在的业务增长。目前我们正在研究的课题有两项: 1)耐药菌相关蛋白靶向的小分子化合物虚拟筛选。2)GPCR靶向的小分子化合物虚拟筛选。利用我们构建的计算机辅助药物筛选平台,结合生物活性实验验证,成功发现多个功能性化合物,已提交两项专利申请。

对于平台的使用,首先用户需要进行注册,填写相关信息,登录平台。选择数据库、提交蛋白质结构文件、填写靶点空间位置信息等,提交筛选任务。筛选的时间与用户选择的数据库大小、用户自定义的靶点空间信息以及蛋白结构有关,选择的数据库越大,筛选需要的时间越长。


目前,平台提供虚拟筛选的试用版本和VIP版本,试用版本提供包含1000个小分子化合物的筛选库,分子量为200~350,来源于先导化合物数据库。用户注册登录后可以提交自己分析好的蛋白结构和靶点信息进行筛选。VIP版本,用户注册登录后需要提交虚拟筛选服务订单,并与我们联系。该版本提供的筛选需要付费后才能使用,该版本包含多个个性化的小分子化合物数据库,如先导化合物数据库、类药化合物数据库、天然产物数据库、中草药成分数据库等,总共包含2000多万个小分子化合物结构。用户可以根据自己的需求进行选择筛选。

平台特色:

  • 高通量的虚拟筛选能力

  • 丰富的数据库资源

  • 专业的技术服务

  • 安全、稳定的虚拟筛选集群环境

  • 高度标准的数据隐私管理

  • 具有竞争力的价格优势